来源：茯神是多孔菌科真菌茯苓菌核中间抱有松根（即茯神木）的白色部分，茯苓是多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核。
所属：茯神属于菌科，茯苓属于中药。
外形：茯神中间有一松树根贯穿，商品多数已经被切成方形的薄片，呈粉质，质地坚实，切断的松根呈棕黄色，表面有圈状纹理（年轮），茯苓有茯苓个、茯苓块、茯苓片三种形态，外形都不同，大小不一。
一、来源区别
1.茯神是多孔菌科真菌茯苓菌核中间抱有松根（即茯神木）的白色部分。
2.茯苓是多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核。
二、所属区别
1.茯神属于菌科。
2.茯苓属于中药。
三、外形区别
1.茯神中间有一松树根贯穿，商品多数已经被切成方形的薄片，呈粉质，质地坚实，切断的松根呈棕黄色，表面有圈状纹理（年轮），其中以内厚实，松根小者为佳。
2.茯苓有茯苓个、茯苓块、茯苓片三种形态，其中茯苓个呈类球形、椭圆形、扁圆形或不规则团块，大小不一，外皮棕褐色至黑褐色；茯苓块是去皮后切制的茯苓，呈立方块状或方块状厚片，白色、淡红色或淡棕色，大小不一；茯苓片是去皮后切制的茯苓，呈白色、淡红色或淡棕色不规则厚片，厚薄不一。
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茯神与茯苓的区别：http://www.3jise.com/article/160284.html